第三军团基地战 -> 格拉纳达废墟战 -> 沙漠战（选择跟从暗黑魔王） -> 沙漠战（选择不跟从暗黑魔王） -> 河口要塞战 -> 火山带森林战 -> 湿地战 -> 东南亚基地战 -> 香港航天基地战 -> 宇宙战 -> 第三次宇宙战 -> 月球面市街战 -> 月球面都市战 -> 决战 -> 最终决战
机体入手顺序第1话：变形金钢 -> 扎古Ⅱ -> 初号机（选择不跟从暗黑魔王） -> 初式高达（选择跟从暗黑魔王） -> 黑盖特 -> 阳电子炮（Boss机）
第2话：百兽王 -> 主角机（名称自选） -> 超电磁机器人 -> 金刚飞碟 -> 大铁人17 -> 母舰拉格朗日
第5话：黑马三世 -> 龙王丸 -> 音速喷射机 -> 初期量产型机（Boss机）
第8话：白色基地 -> 扎古Ⅱ改 -> 沙扎比 -> Z高达 -> Z高达MK2 -> 葵曼莎（Boss机）
隐藏机体入手方法盖塔皇帝：游戏通关后重新选择游戏难度，并与主角机对话后获得
盖塔龙：游戏通关后重新选择游戏难度，并与盖塔皇帝对话后获得
路线选择影响结局第4话：选择是否跟从暗黑魔王会影响初期机体。选择跟从暗黑魔王可获得初式高达，否则获得初号机。
第11话：选择是否摧毁暗黑魔王会影响后续剧情和最终结局。
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